Saralystkirken har naturligvis et menighedsråd der står for den overordnede ledelse af kirken.

Menighedsrådet består af fem personer, foruden præsten, og fungerer som ledelse for kirken, som er en selvejende institution.

Menighedsrådets medlemmer vælges for to år af gangen på den årlige generalforsamling, årsmødet, der finder sted først på året.
Præsten, John Lorenzen, vælges dog ikke da han er født medlem af ledelsen.

Menighedsrådet består af:

• Werner Berle, formand
• Jørgen Møller, økonomikontakt
• Hanne Bering
• Ulle Christensen
• Karen Henneberg, smågruppekoordinator
• John Lorenzen, præst